Ziel der Akademie ist die Veröffentlichung und wissenschaftliche Erschließung der Werke des Franziskanertheologen Johannes Duns-Scotus, im Kontext des ökumenischen Dialoges.
Im Geist des heiligen Franziskus fördern und unterstützen die Kommissariate ordenseigene Projekte. Ihre Sorge gilt besonders der Erhaltung und Betreuung der Stätten im Heiligen Land.
Der Franziskaner, Priester und Biologe Osmund Klug hatte über viele Jahre Insekten wissenschaftlich akkurat gesammelt. Diese wurden nun dem Landesmuseum übergeben.